大家好，今天跟大家分享一篇题为Joint epi genome profiling reveals cell-type-s pecific gene regul atory progra mmes in human cortical org anoids（联合表观基因组分析揭示了人类皮质类器官中细胞类型特异性基因调控程序）基因表达受到多种表观遗传机制的调节，这些机制在发育和疾病中相互...阅读全文... 阅 读 全 部 >
长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展HPV（人类乳突病毒）整合入人类基因组，往往被认为是宫颈癌发展的重要环节之一，但具体的整合位置和机制目前尚未完全被揭示清楚。在本文中，来自浙大医学院附属邵逸夫医院和附属妇产科医院、华中科技大学和温州中心医院等单位的研究者采用Nanopore测序技术，对16 例HPV16阳性的宫颈肿瘤样品进行大规模检测，重点关注 病毒-人基因组整合事件；相关成果发... 阅 读 全 部 >
前言在生命科学领域，单细胞测序技术被誉为“打开细胞异质性黑箱的金钥匙”。而单细胞全长转录组测序（Single-cell Full-Length Transcriptome Sequencing），作为该技术的“升级版”，不仅能够解析单个细胞的基因表达全景，还能精准捕捉mRNA的完整结构信息（如可变剪切、融合基因、新转录本等）。这一技术正在推动发育生物学、肿瘤微环境、免疫治疗等领域的研究走向更...... 阅 读 全 部 >
基因测序方法有哪些？当今的主要技术基因测序技术相对成熟，DNA测序的主要方法有Sanger 测序、下一代测序 (NGS) 和长读长测序。以下是对这些方法、优缺点和重要标准的简要回顾，可帮助您权衡下一个测序选择。选择测序方法的标准选择测序方法的标准很多，取决于研究人员及其项目的性质。正在研究的生物学问题是关键。Pacific Biosciences 副总裁 Jonas Korlach 说：...阅读... 阅 读 全 部 >
长读长测序（ LRS）技术被《Nature Methods》评为“2022年度方法”，被广泛用于许多代表性物种的基因组测序中。该技术在科学研究中具有巨大作用和潜力，2021年LRS的市场价值为13.5亿美元，预计到2031年将达到44亿美元，从2022年到2031年的年均复合增长率达到14.4%。 在本文中，作者讨论了LRS技术的应用现状和优势、LRS的成功案例和新发现、LRS在植物基因...阅读... 阅 读 全 部 >
淹水胁迫对植物的生长发育有负面影响，研究耐涝机制对分子育种的研究具有重要意义。中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料，结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析，揭示了猕猴桃的耐涝机制，并在《International Journal of Molecular Sciences》（IF=6.208/化学2区）期刊上发表了题为“Full-Length ...阅读... 阅 读 全 部 >
导读三代测序和de novo组装技术发展得如火如荼，是如今高通量测序最热门的技术。今天为大家分享一篇三代测序和de novo组装在植物方面应用的综述文章，希望帮助更多的科研小伙伴们了解这项技术，并应用到自己的科研工作中。发表期刊：Current Opinion in Plant Biology发表时间：2020.01.22影响因子：7.508...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
近两三年中，测序平台又有了突破式的革新。虽然Illumina的二代测序平台仍是市场主流，但随着Pacific Biosciences公司商业化的三代测序仪平台成功推出，三代测序已正式应用于各项研究中。与之前的平台相比，三代测序技术无需PCR扩增就可实现对每一条DNA分子的单独测序。由于三代测序读长长、无扩增及GC偏好性，目前广泛应用于动植物de novo测序辅助组装及全长转录组测序。那么三代测序在... 阅 读 全 部 >
上次小编给大家介绍了，大家看过之后是不是也有一种想发高分文章的冲动？古语云“九层之台，起于累土”，今天小编就给大家重点介绍一下好文章背后的故事------PacBio三代测序的文库制备。首先，我们来认识一下三代测序的文库结构，与二代测序线状的文库结构不同，三代测序的文库是“哑铃型”的环状结构，中间是插入片段，两端分别是茎环结构的接头（图1）。这种“哑铃型”文库是三代文库设计的最大亮点，环状的文..... 阅 读 全 部 >
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