SLAM-seq（thiol(SH)-linked Alkylation for the Metabolic sequencing of RNA）可以理解为“S4U烷基化RNA代谢测序技术”，通过核苷类似物(S4U) 标记和高通量测序方法，实现对新生RNA与原有RNA的定量和识别。SLAM-seq技术有助于检测RNA的半衰期与稳定性变化，鉴定RNA修饰所介导的靶基因变化，以及揭示mRN...阅读全... 阅 读 全 部 >
在所有生命领域中，蛋白质是由核糖体合成的，这个过程被称为翻译。翻译调控的整个幅度和强度超过了转录、mRNA降解和蛋白质降解的总和。因此，在全转录层面内研究RNA的翻译事件至关重要。翻译组测序最初是在酿酒酵母中研究，后来慢慢在很多物种中都有研究，人和小鼠研究最多。翻译组测序可以研究细胞内基因翻译的水平、区域、速率等，结合表观转录组、转录组、小RNA测序、蛋白组等进行关联分析，可以更精确地研究转...... 阅 读 全 部 >
责编 | 兮在众多的组蛋白修饰中，基因活化状态的标志物组蛋白H3上第4位的赖氨酸三甲基化（H3K4me3）是被研究得最为广泛的PTMs之一，在哺乳动物细胞中其可以被6种不同的COMPASS复合物催化生成【5-8】。由于H3K4me3在基因启动子附近的富集水平与基因表达水平正相关，因此长久以来H3K4me3一直被认为是可以促进基因转录起始的。这一假说可以被一些体外生化实验结果得以支持；此外，蛋白质谱... 阅 读 全 部 >