分类目录归档：组学教程

2025
08-03

Nature communication | 长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展

长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展HPV（人类乳突病毒）整合入人类基因组，往往被认为是宫颈癌发展的重要环节之一，但具体的整合位置和机制目前尚未完全被揭示清楚。在本文中，来自浙大医学院附属邵逸夫医院和附属妇产科医院、华中科技大学和温州中心医院等单位的研究者采用Nanopore测序技术，对16 例HPV16阳性的宫颈肿瘤样品进行大规模检测，重点关注 病毒-人基因组整合事件；相关成果发... 阅 读 全 部 >
2025
08-03

单细胞全长转录组测序 | 从原理到应用，一文读懂细胞转录的“完整密码”

前言在生命科学领域，单细胞测序技术被誉为“打开细胞异质性黑箱的金钥匙”。而单细胞全长转录组测序（Single-cell Full-Length Transcriptome Sequencing），作为该技术的“升级版”，不仅能够解析单个细胞的基因表达全景，还能精准捕捉mRNA的完整结构信息（如可变剪切、融合基因、新转录本等）。这一技术正在推动发育生物学、肿瘤微环境、免疫治疗等领域的研究走向更...... 阅 读 全 部 >
2025
08-02

常用基因测序方法种类及优缺点

基因测序方法有哪些？当今的主要技术基因测序技术相对成熟，DNA测序的主要方法有Sanger 测序、下一代测序 (NGS) 和长读长测序。以下是对这些方法、优缺点和重要标准的简要回顾，可帮助您权衡下一个测序选择。选择测序方法的标准选择测序方法的标准很多，取决于研究人员及其项目的性质。正在研究的生物学问题是关键。Pacific Biosciences 副总裁 Jonas Korlach 说：...阅读... 阅 读 全 部 >
2025
07-27

三代全长测序和二代转录组测序技术相结合的应用

淹水胁迫对植物的生长发育有负面影响，研究耐涝机制对分子育种的研究具有重要意义。中国农业科学院郑州果树研究所研究团队选取猕猴桃耐涝基因型KR5为研究材料，结合三代SMRT测序和二代测序进行了转录组分析，揭示了猕猴桃的耐涝机制，并在《International Journal of Molecular Sciences》（IF=6.208/化学2区）期刊上发表了题为“Full-Length ...阅读... 阅 读 全 部 >
2025
07-27

三代测序长读长，组装技术哪家强？

导读三代测序和de novo组装技术发展得如火如荼，是如今高通量测序最热门的技术。今天为大家分享一篇三代测序和de novo组装在植物方面应用的综述文章，希望帮助更多的科研小伙伴们了解这项技术，并应用到自己的科研工作中。发表期刊：Current Opinion in Plant Biology发表时间：2020.01.22影响因子：7.508...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2025
07-27

三代长读长测序了不起吗？多篇疾病高分文章告诉你

近两三年中，测序平台又有了突破式的革新。虽然Illumina的二代测序平台仍是市场主流，但随着Pacific Biosciences公司商业化的三代测序仪平台成功推出，三代测序已正式应用于各项研究中。与之前的平台相比，三代测序技术无需PCR扩增就可实现对每一条DNA分子的单独测序。由于三代测序读长长、无扩增及GC偏好性，目前广泛应用于动植物de novo测序辅助组装及全长转录组测序。那么三代测序在... 阅 读 全 部 >
2025
07-27

二代变三代，文库构建变在哪？

上次小编给大家介绍了，大家看过之后是不是也有一种想发高分文章的冲动？古语云“九层之台，起于累土”，今天小编就给大家重点介绍一下好文章背后的故事------PacBio三代测序的文库制备。首先，我们来认识一下三代测序的文库结构，与二代测序线状的文库结构不同，三代测序的文库是“哑铃型”的环状结构，中间是插入片段，两端分别是茎环结构的接头（图1）。这种“哑铃型”文库是三代文库设计的最大亮点，环状的文..... 阅 读 全 部 >
2025
07-26

三代+二代全新宏基因组测序分析产品闪亮登场

转眼间，十月已经到来，十月是一个充满希望的时节，是一个硕果累累的季节。在这么美好的时节里小锐有很多新技术、好消息与大家分享，接下来先向大家隆重介绍三代+二代宏基因组测序分析产品。随着测序技术的不断更新，三代测序技术也越来越成熟，Nanopore测序读长更长，错误率更低，对生物信息相关领域的研究具有重大意义。近年来Nanopore测序的宏基因组高分文章已发表多篇，且已成功应用于微生物宏基因组研究领域... 阅 读 全 部 >
2025
07-25

Nanopore全长转录组测序数据评估，来也！

纳米孔测序是一种由ONT（Oxford Nanopore Technology）研发的单分子测序技术。在转录组测序应用中，相比于传统二代RNA-Seq测序技术，长读长的纳米孔RNA测序可以在无需打断的条件下得到全长序列并进行定量，同时直接RNA测序还可以检测多种碱基修饰，且测序无需扩增，减少了PCR过程引入的碱基偏倚。ONT测序技术在多个方面具有非常强悍的优势，然而，一份合格的下机数据才是科研成功... 阅 读 全 部 >
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