2022
11-20
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RIP测序与分析报告
1. 工作流程RNA免疫共沉淀（RIP）是一种用于研究蛋白质与 RNA 的体内相互作用的经典实验技术。采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀，由此可以把目的蛋白所结合的RNA片段也富集下来。通过与高通量测序技术的结合，对 RIP 后的RNA 产物进行测序分析， 从全基因组范围内寻找目的蛋白的 RNA 结合位点，以高效率的测序手段得到高通量的数据结果。1.1. RIP ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
分类目录归档：组学教程
1. 工作流程RNA免疫共沉淀（RIP）是一种用于研究蛋白质与 RNA 的体内相互作用的经典实验技术。采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀，由此可以把目的蛋白所结合的RNA片段也富集下来。通过与高通量测序技术的结合，对 RIP 后的RNA 产物进行测序分析， 从全基因组范围内寻找目的蛋白的 RNA 结合位点，以高效率的测序手段得到高通量的数据结果。1.1. RIP ...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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circRNA建库与分析流程
文库构建样品质检合格后，Input样品，使用去核糖体转录组建库，IP样品，核糖体含量低，采用全转录组建库。文库构建完成后，随后使用 Agilent 2100 Bioanalyzer 对文 库大小范围进行检测，插入的目的片段大小符合预期后，使用 Q-PCR 方法对文库的有效浓度进行准确定量（文库有效浓度 ＞3nM），以保证文库质量库检合格后，将不同文库按照有效浓度及目标下机数据...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2022
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lncRNA建库与分析流程
1. 建库测序流程1.1. Total RNA 样品制备和检测(1)使用 NanoDrop 2000 分光光度计对 RNA 样品进行初步定量；(2)使用 Aglient 2100 对 RNA 样品浓度精确定量。 RNA 总量、浓度、完整性 （RIN 值，RNA Integrity Number）、纯度（OD260/OD280 比 值）符合收样立项标准后，进入下一...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
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micRNA建库与分析流程
建库测序流程MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA，miRNA 是生物体内一类重要的特殊分子，诱导基因沉默，参与细胞生长、发育、基因转录和翻译等诸多生命活动的调控过程。从RNA样品到最终分析结果数据，需要经过样品检测、建库、测序和信息分析等过程，其中测序过程我们采用高通量测序illumina HiSeq/MiSeq测序平...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
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染色质免疫共沉淀测序ChIP-Seq结题报告（解读）
技术服务描述此文为Chip-seq报告的解读文件：以下红字灰色背景为每一小节的结果解读信息结果解读位于每一小节末尾1. 工作流程染色体免疫共沉淀（ChIP）是一种用于研究蛋白质与 DNA 的体内相互作用的经典实验技术。采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀，由此可以把目的蛋白所结合的基因组 DNA 片段也富集下来。通过与高通量测序技术...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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CHIP分析qc解读报告链接
QC ReportgeneralReport generated at2021-01-13 22:36:11TitleDemo-H3K27me3DescriptionThis is a input JSON for Demo-H3K2...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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(mRNA)转录组测序及分析报告
转录组测序及分析报告项目信息合同编号：DEMO-2021-01-29-xx客户姓名：Client-name客户单位：Unit-address1. 分析流程1.1. 建库测序流程从RNA样品提取到最终数据获得，样品检测、建库、测序等每一环节都会直接影响数据的数量和质量，从而影响后续数据分析的结果。为从源头保证测序数据准确可靠，在数据的所有生产环节都严...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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项目名称：mRNA实验建库流程与分析流程（polyA 建库）
技术服务描述建库流程从RNA样品提取到最终数据获得，样品检测、建库、测序等每一环节都会直接影响数据的数量和质量，从而影响后续数据分析的结果。为从源头保证测序数据准确可靠，在数据的所有生产环节都严格把关，从根源上确保高质量数据的产出。建库测序的流程如下所示：Total RNA 样本检测RNA 富集双链c...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
11-19
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Chip差异Peak分析结果及报告
1. 概述1.1. 背景及分析流程简介为了理解细胞中更为复杂的生物过程，许多研究已在通过比较ChIP-seq的差异获得的不同数据。越来越多的ChIP-seq实验正在研究多种实验条件（例如各种治疗条件，几个不同的时间点和不同的治疗剂量水平）下的转录因子结合，组蛋白修饰的差异。差异富集在生物学和医学研究中已变得具有实际重要性。为了建立对比条件消除误差，我们对数据进行了以下流程处...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
2022
11-19
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Enhancer 与 Super-enhancers
1. Enhancer 与 Super-enhancers1.1. 增强子（Enhancer）所谓增强子（Enhancer），位于结构基因附近，是一类非编码DNA顺式作用元件，在真核生物的发育过程中通过结合转录因子、辅因子以及染色质复合物作用于启动子，可以激活或增强基因的转录。简单说：增强子是能够增加启动子活性从而增加基因转录频率的DNA序列。图1. 增强子及复合物...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >