2022
06-02
06-02
宏基因组分析-基于binning
一、介绍宏基因组 ( Metagenome) 指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。一般从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序,从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法:基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。下面我们介绍基于bin的分析方法。二、分析流程...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
病毒是一种个体微小,结构简单,只含一种核酸(DNA 或 RNA),必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖的非细胞型生物。病毒是地球上丰度最高的“生物”类群,它们广泛地存在于所有已知的生态环境中,从水体,土壤再到人体,病毒无处不在。病毒能够感染所有已知的生物类型,从动物、植物到微生物,包括细菌和古菌。人体内的病毒主要包括真核病毒和噬菌体,按核酸类型,可分为双链DNA(double-s...阅读全文>...
随着高通量技术的发展,宏基因组学(metagenomics)已经成为研究微生物群落物种及功能的前沿科学,在肠道微生物、环境微生物等研究领域具有广泛应用。宏基因组学通过对微生物群落全部DNA进行高通量测序,将测序序列与公共数据库进行比对或从头组装出微生物基因组,从而识别微生物群落的物种和功能基因。目前主流的宏基因组数据分析方法包括三种:基于测序结果进行组装的分析方法;基于reads直...阅读全文&...
一、介绍宏基因组 ( Metagenome) 指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。一般从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序,从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法:基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。下面我们介绍基于组装的分析方法。二、分析流程介...阅读全文>>...
一、 介绍宏基因组 ( Metagenome) 指特定环境下所有生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因。一般从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序,从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法:基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。下面我们介绍基于Reads比对的分析方...阅读全文>>...
一、 介绍细菌基因组研究,是通过基因组测序和组装,获得细菌全基因组序列,并对基因组开展结构预测,功能注释、比较基因组学及泛基因组研究。依据研究精细程度不同,分为框架图(也称为草图)、完成图(0gap),下面我们主要介绍框架图的分析内容。二、 分析流程基本流程为,建库测序,序列优化,基因组组装,基因及结构预测,功能注释,画图展示。三、 分析步骤与结果展示1、测序序列...阅读全文>>...
欧洲共同语言参考标准(The Common European Framework of Reference for Languages,简称CEFR)是被国际认可的描述语言能力和水平的标准。欧洲语言共同参考框架(CEFR)是描述语言能力的国际标准。 它用6分制来描述语言能力,从初学者的A1到已经熟练掌握一门语言的C2。 这使得任何参与语言教学和测试的人,如教师或学习者,都很容易...阅读全文>...
对于很多参加剑桥系列考试的小伙伴而言,CEFR是一个相当熟悉的词了,但其他的小伙伴可能还是不太了解,今天就和小沃一起了解一下吧。CEFR全称欧洲语言教学与评估框架性共同标准。什么是“CEFR-欧洲语言教学与评估框架性共同标准”(以下简称CEFR)?CEFR全称是CommonEuropean Framework of Reference for Languages,由欧洲语...阅读全文>&g...
如果有考过雅思的老师或者家长,你有没有关注过你的雅思成绩单上的这个符号呢?你知道“CEFR”代表什么意思吗?我们今天就来揭秘“CEFR”。01CEFR是什么?CEFR全名为Common European Framework of Reference for Language,中文为欧洲共同语言参考标准,是欧洲语言测试者协会(ALTE)与2001年发布的...阅读全文>>...
在疫情的影响下,不仅让学生的上学时间不断推迟,各种国际化语言测试也取消了大陆地区的考试场次,小托福取消了3月的考试,4月的KET/PET考试虽未取消,但也在讨论商议中。对于一些还没想好是选择ETS的小托福测试还是剑桥的少儿英语KET/PET测试的家长来说,这下一次性解决爸爸妈妈们所有疑惑!今天,小E将带大家从多方面去科普小托福和KET+PET英语测试,快来收藏吧!测试对象小托福说到小托福(TOEF...