近年来，越来越多的研究表明，单一或者少数参考基因组不能涵盖整个种群全部的遗传信息，所以，构建物种的泛基因组成了当前基因组学研究的热点和前沿。本篇文章，小编和大家一起来了解一下泛基因组的构建方式、泛基因组的热点研究内容。一、泛基因组的构建策略泛基因组构建主要分为以下三种方式[1]：（1）选取一个参考基因组，各个材料的测序reads分别比对，将未比对上的reads进行组装，通过“比对-组装”的迭代过程... 阅 读 全 部 >
gff3格式注释文件是最常见的基因注释，（https://archive.broadinstitute.org/annotation/argo/help/gff3.html）简单来说，gff3是以tab分隔的文本文件，共有9列，对应信息如下：1、seqname The name of the sequence. Typically a chromosome or a contig. Argo ..... 阅 读 全 部 >
前期的推文中我们介绍了一种基于末端标签序列研究染色质交互作用的方法（ChIA-PET），本期中，我们再介绍一种应用更加广泛的染色质三维结构信息捕获方法——Hi-C.一、Hi-C技术的发展一提到Hi-C，我们不得不先说下它的老祖宗，3C，即Chromosome Conformation Capture。2002年，Job Dekker团队在《Science》发文，首次报道了...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
二十一世纪之初，在多国科学家的共同努力下，人类基因组草图被成功绘制。但让人们大吃一惊的是在人类基因组中能够编码蛋白质的基因只占整个人类基因组的不到2%，其余超过98%的人类基因组是做什么的还不清楚，有科学家把这些DNA叫做“垃圾DNA”，或基因组里的“暗物质”。为了解析这些所谓“垃圾DNA”的结构和功能，在2003年由美国人类基因组研究所(NHGRI)和欧洲生物信息研究所(EMBL)牵头，开展了E... 阅 读 全 部 >
自盘古开天辟地以来，世间出现过不少能让人血流满地的“凶兽”，包括但不限于：饕餮、年兽、小奶猫及小奶狗等……WHAT？汪星人和喵星人都算？不过，爱好英语学习，又爱好萌宠的你，是否知道奶喵及奶汪的英文怎么说吗？可别想当然地说little milky cat，正确说法是什么呢？Kitten – 小奶猫不用说大家都知道猫咪的英文就是cat，这个词，是猫这种动物的总称。比如：T...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
1.进化树1.0版本上一期已经给大家介绍根据基因或者蛋白ID在NCBI上进行BLAST并下载FASTA序列，然后将序列导入MEGA软件中进行比对，最后生成.meg的序列比对文件。那么用这个文件是不是就能构建进化树呢，当然可以。方法也很简单，单击菜单【File】→【Open A File/Session】，打开上述.meg文件，点击工具栏中的【PHYLOGENY】→【C...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
通过前两周的《本地化适应是怎么发生的？》和《突变是否影响个体的适应性？》了解了群体的核酸多样性后，我们接下来就开始要着手进行功能基因的定位了。工欲善其事，必先利其器。在我们可以自由选用各类实验设计前，我们需要了解各种方法的基本原理。让我们先从连锁分析开始。1. 连锁分析的基本原理既然群体中产生了多样性，我们就期望将与性状相关的基因定位出来。在之前的文章中，我们提到功能基因定位的方法主要包...阅读... 阅 读 全 部 >
前几天有烤鸭催着小编要澳门考试攻略，那小编加班加点，综合了两位烤鸭 “动动” 和 “静静” 的澳门考雅思经历，汇总成一篇，送给有需要的烤鸭~~前记自从决定了要去新西兰，雅思A类4个7就列入了日程。和很多雅思小白一样经历了到处加群找资料咨询机构之后，得出的结论是---中国大陆雅思压分！尤其口语和写作！鉴于我已经是非英专的工作五年的大龄通讯狗，对自己实在没有信心。于是离广东很...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
很多小伙伴常常会问到雅思的问题：听说有好几种雅思考试？我这种情况要考哪种雅思？UKVI雅思是不是比普通雅思简单？雅思一年考几次？什么时间考试？...今天，小申菌就来解答大家的疑问。带上小本子，认真做好笔记哦！一、雅思考试类型雅思考试分成三大类：普通雅思考试用于英国签证及移民的雅思考试（UKVI）和雅思生活及技...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
一、Pubmed 更 新PubMed已经更新一段时间了，今天带大家重新了解下操作技巧。01 广撒网，多捞鱼在科研课题决定之初，利用Pubmed进行充分的文献调研早已是一件家常便饭的事情，然而让人头疼是，在搜索关键词后，跳出的结果大多不是自己想要的剧情，很多与关键词不匹配的文章充斥其中，无疑加大了研究者文献筛选的工作量。 举个栗子，打开Pubmed网页之后，在检索框中，输入...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >