【On hold】目录众所周知，一旦期刊被打上「On Hold」标签，其结局无非两种——恢复收录或彻底剔除（elife是个意外，没被剔除但被降级为ESCI）。近两年来，科睿唯安每月都发布一批剔除名单，其中包括很多 On Hold 期刊， 究竟这类期刊的“存活率”有多低呢？本期小编用数据给大家分析期刊解除On hold的概率到底有多大！1 「On Hold」状态官方解读当期...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
期刊被On hold，意味着有人对该期刊发表内容的质量表示关切。该期刊正在根据科睿唯安的选择标准进行重新评估；在重新评估的过程中，新的内容将不会被收录。评估完成后，出版商将被告知评估结果，该期刊将被：如果它不再符合质量标准，则从覆盖范围中删除；或如果它继续符合质量标准，则继续覆盖；如果该期刊符合质量标准，任何缺失的内容将被编入索引。如果该期...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
蛋白质组学（proteomics）专注于研究细胞、组织或整个生物体中的所有蛋白质，不仅关注蛋白质的存在，更重要的是它们的表达水平、修饰状态、相互作用以及功能。蛋白质组学的研究具有重要的科学和应用价值。以下，我们将通过一系列精心设计的问题，带您走进蛋白质组学的世界！学习大纲一、蛋白质组学研究意义何在？二、市面上常见的蛋白质组学技术分类有哪些?三、如何选择蛋白质组学...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
1. 介绍一般蛋白质组学数据用于文章发表时，杂志会要求上传质谱数据至公共数据库，供同行下载和分析。ProteomeXchange 是目前使用最多的蛋白质组学数据储存平台。ProteomeXchange旗下的成员包括PRIDE (EMBL-EBI,Cambridge,UK)，PeptideAtlas(ISB, Seattle,WA,USA)，MassIVE (UCSD,San ...阅读全文&g... 阅 读 全 部 >
数据库的提供了生物信息学的极大便利，也是数据挖掘的基础。现在最常见的数据库主要是GEO，TCGA，OMIM等数据库，尤其是前两者，几乎是肿瘤数据挖掘的必备数据库，TCGA更是专门肿瘤数据库。但是科学研究并不全是肿瘤研究，这里精选介绍3种强大的，而且是非肿瘤的数据库，希望对大家有用。1peoteomexchange数据库peoteomexchange数据库是专门蛋白质组学的数据库，包含了各种疾病和各... 阅 读 全 部 >
很多在华盈生物完成质谱检测服务后的客户，到了文章发表的阶段都会咨询如何上传原始数据到公共数据库这个问题。对于组学研究来说，文章发表时杂志社一般会要求将原始数据上传到公共数据库，并在正文中提供相应数据库编号供同行下载，以重新进行数据分析和核对。随着蛋白组学的发展，专门供质谱原始数据储存和分享的数据库也出现了，功能也日趋完善。今天，小编将为大家介绍一款目前应用体验度排名靠前的数据库——Prote...... 阅 读 全 部 >
上一期我们介绍了R语言数据读取的方法，这期我们一起全面了解下R语言的数据与图像输出的方法。在数据分析和可视化过程中，输出数据和图像至关重要。R语言提供了丰富的函数和包，用于导出数据文件和生成多种格式的图像文件。本期我们一起了解常见的数据和图像输出方法。R语言中的数据与图像输出方法一、数据输出方法Rstudio输出数据Rstudio输出数据非常简单，在Environment窗口中点击...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
R语言是一种开源的统计编程语言，主要用于数据分析、统计建模和数据可视化。自20世纪90年代开发以来，R在数据科学和生物信息学等领域获得了广泛应用，其丰富的包资源和开源社区的活跃支持使其在数据分析工具中脱颖而出。上次我们介绍了R包的安装方法，这次我们一起来学习R语言导入数据的7种方法。R语言的界面R语言中数据输入与读取方法数据输入与读取是数据分析的第一步，R语言为此提供了多种便捷的工...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
必备软件Aspera 插件 下载网址 ： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra_sub/sub.cgi“每个过程对应的网址：NCBI注册 网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/申请BioProject 网址：https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
高通量测序时代，大量的原始测序数据都流向了NCBI的SRA数据库。尽心尽责的将文章有关的测序数据上传至公共平台发布，一方面，是对生物领域科学研究的奉献，方便数据再利用，进行新探索；另一方面，可进行数据分析重现、验证等，为课题研究的真实性提供依据。 但是，很多操作过数据上传的小伙伴们都发现，认真做好这件事可真不容易，成功拿到传说中的SRA accession number（序列检索号码）仿佛经历..... 阅 读 全 部 >