蛋白质组学（proteomics）专注于研究细胞、组织或整个生物体中的所有蛋白质，不仅关注蛋白质的存在，更重要的是它们的表达水平、修饰状态、相互作用以及功能。蛋白质组学的研究具有重要的科学和应用价值。以下，我们将通过一系列精心设计的问题，带您走进蛋白质组学的世界！学习大纲一、蛋白质组学研究意义何在？二、市面上常见的蛋白质组学技术分类有哪些?三、如何选择蛋白质组学...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
当我们投身于蛋白质的研究时，探索的焦点通常汇聚于蛋白质表达的动态变化、蛋白质发生翻译后修饰的精妙调控、蛋白质间错综复杂的相互作用、蛋白质所参与的生命过程和功能、三维结构的奥秘以及作为药物靶点的潜力。每一个研究方向都蕴含着丰富的知识并彼此交织，共同编织出蛋白质世界的复杂图景。为了应对这一领域的复杂性，我们精心整理了一系列常用的蛋白质研究数据库，旨在为科研工作者提供高效便捷的信息资源，节省宝贵的...... 阅 读 全 部 >
1如何向PRIDE提交数据PRIDE可以直接提交蛋白质和多肽鉴定/定量数据以及随附的质谱证据和任何其他相关数据类型。PRIDE支持任何实验方法得到的蛋白质组学数据集的存储。当前，向PRIDE提交数据的方式是使用“PX Submission tool”（详细操作步骤与附于文末）。2注册成为PRIDE注册用户在提交到PRIDE数据库之前，用户需要确保它具有使用PRIDE资源的帐户。如果您还没有PRID... 阅 读 全 部 >
在蛋白质组学如火如荼的今天，许多科研工作者在进行涉及到蛋白质组学的研究成果的投稿时，编辑一般会要求作者在第三方平台上提交蛋白组学的原始数据（“Public availability of data”）。 因此客户宝宝问题就来了：怎么上传原始数据，上传到哪个数据库，都需要上传哪些数据？今天小编就给大家介绍一下原始数据上传的那些事。原始数据上传到哪？ProteomeXchange(简称PX...阅读全... 阅 读 全 部 >
很多在华盈生物完成质谱检测服务后的客户，到了文章发表的阶段都会咨询如何上传原始数据到公共数据库这个问题。对于组学研究来说，文章发表时杂志社一般会要求将原始数据上传到公共数据库，并在正文中提供相应数据库编号供同行下载，以重新进行数据分析和核对。随着蛋白组学的发展，专门供质谱原始数据储存和分享的数据库也出现了，功能也日趋完善。今天，小编将为大家介绍一款目前应用体验度排名靠前的数据库——Prote...... 阅 读 全 部 >
本期小编将分享关于小基因组数据NCBI上传流程，那小基因组包含哪些基因组呢？小基因组主要包括线粒体、叶绿体、病毒、质粒等，由于这些基因组大小通常小于1M，因此统称为小基因组。基于高通量测序技术，对小基因组进行全基因组测序，可以得到其全基因组序列，并预测其重要的功能基因。基于全基因组序列，对于线粒体/叶绿体可以进一步研究物种分类、进化关系等；对于病毒、质粒可以则可以进一步研究致病性、...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
高通量测序时代，大量的原始测序数据都流向了NCBI的SRA数据库。尽心尽责的将文章有关的测序数据上传至公共平台发布，一方面，是对生物领域科学研究的奉献，方便数据再利用，进行新探索；另一方面，可进行数据分析重现、验证等，为课题研究的真实性提供依据。 但是，很多操作过数据上传的小伙伴们都发现，认真做好这件事可真不容易，成功拿到传说中的SRA accession number（序列检索号码）仿佛经历..... 阅 读 全 部 >
每年的1-3月份是很多老师撰写国自然本子的主要时期，但是每年这个时期都会有老师因为各种各样的原因，导致实验计划延迟而拿不到需要的实验数据，因此需要借助数据库已有的数据做数据分析为基金申请做理论支撑。另外由于很多突发的因素产生，科研人员往往无法及时开展实验工作，因此更需要借助数据库数据，这在今年的新冠肺炎疫情中体现特别明显，在疫情发生的早期，就陆续发表了多篇研究论文，分析讨论新冠肺炎病毒靶向蛋白血管... 阅 读 全 部 >
引很多老师在写文章的时候，精力通常会放在文章中的技术或者实验细节，而疏忽原始数据上传的工作。文章准备接收时，审稿人需要老师提供文章中使用数据的登录号，一般时间要求较紧，对于没接触过数据上传的老师来说，可能会成为文章接收最后的绊脚石，为此我们撰写了一份高通量测序数据上传指南，可以让老师快速掌握数据上传的技能，助力老师文章发表。目前高通量测序原始数据通常上传到NCBI的SRA(The ...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
还在为不知如何上传GEO数据库而发愁吗？还在为不愿意看繁琐的英文帮助而不知所措吗？一篇帖子教你如何上传GEO数据库，建议收藏，再也不用愁“书到用时方恨少”了。1、创建账号如果要上传GEO数据库，首先要创建NCBI帐号， 网址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/登录成功后，回到GEO的主页，点击 Submissi...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >