SLAM-seq测序
翻译组学测序研究利器|Ribo-seq&Polysome-seq
Nature｜王华等揭示H3K4me3在转录调控中的具体作用
图片美不美，关键看色彩。毫无疑问，图表的色彩搭配直接决定图表给读者的感受和印象，漂亮的图表自然会给文章增色不少。因此，学会自定义图表的配色非常重要。那么，怎么给图表选择一组漂亮的颜色呢？本文以R语言（ggplot2）作图为例，介绍3种色彩搭配（获取一组配色颜色值）的方法。1从R包中提取配色集配色的本质就是得到一组搭配十分“和谐”的颜色。R中的常见颜色的表示方式有16进制颜色码，英文代码，...阅读... 阅 读 全 部 >
Twitter是一个流行的社交网络，这里有大量的数据等着我们分析。Twitter R包是对twitter数据进行文本挖掘的好工具。 本文是关于如何使用Twitter R包获取twitter数据并将其导入R，然后对它进行一些有趣的数据分析。第一步是注册一个你的应用程序。为了能够访问Twitter数据编程，我们需要创建一个与Twitter的API交互的应用程序。注册后你将收到一个...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
小RNA中的丰度分布十分不均，少数种类小RNA的丰度占全部的比例较高，研究重点也都放在丰度较高的小RNA上，小RNA长度分布图可以有效筛选丰度较高的小RNA，我们以文献“Characterization of mouse serum exosomal small RNA content: The origins and their roles in modulating inflammato...... 阅 读 全 部 >
给直方图和线图添加误差棒 准备数据这里使用ToothGrowth 数据集。它描述了维他命C对Guinea猪牙齿的生长影响。包含了三种不同的剂量（Vitamin C (0.5, 1, and 2 mg)）和相应的两种不同使用方法（ [orange juice (OJ) or ascorbic acid (VC)]）。library(ggplot2) df <...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
导语GUIDE ╲我们平时说的小提琴图其实是箱式图与核密度图的结合，箱式图展示了分位数的位置，小提琴图则展示了任意位置的密度，小提琴图可以展示密度较高 的位置。下面我们一起来看看几种绘图R包。 小提琴图是通过使用密度曲线描述一组或多组的数值数据分布。每条曲线的宽度对应于各区域数据点的近似频率。通常密度会随附一种叠加的图表类型，如箱形图，以提供一些其他的数据信息，即矩形上下边框代表第一个和第三个四分... 阅 读 全 部 >
作者：Bruno Rodrigues原文链接：https://www.brodrigues.co/blog/2018-10-05-ggplot2_purrr_officer/来源：R语言最近我面临以下的问题：创建数以百计的图片以便我们的客户仍旧可以编辑。这意味着我需要把图表导出到Excel、PPT或者其它客户熟悉的工具，而不是像往常那样把图片直接以pdf或者png形式导出。尽管我还是希望使用R解决... 阅 读 全 部 >
前言作图的时候常出现一个问题，我把 windows 系统字体“ Times New Roman ”指定为图形里的字体，虽然在 RStudio 图形窗口会显示指定字体，但是在保存为 PDF 时出现问题， 出现字体类别错误，指定字体无法显示。library(readxl)Bar <- read_excel( "Bar.xlsx", col_types = c( "tex...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
1.前言（回顾R语言colortools）合理的配色对于分析图形而言是必不可少的组成部分。通过上一篇colortools基础知识的介绍（点击查看），相信大家对colortool包颜色生成的过程与命令都已经掌握，本篇开始会应用所学到的调色技巧生成几种常用的色彩组合。wode需要大量使用颜色的分析分为三大类，包括第一类双变量、三变量关系的探索；第二类多维度数据探索及数据分析；以及第三类矩阵、...阅读... 阅 读 全 部 >
1、基础描述分析历史上有这样一幅著名的图，它出自1854年的克里米亚战场之中，一名叫南丁格尔的护士利用一幅扇状的玫瑰饼图展示了她所管理的野战医院里不同季节中死于不同病因的病人数变化（见图1），直观地让英国政府看到：每年死于感染的士兵数（即蓝色区域）比死于战场（红色区域）和其他原因（黑色区域）的要多得多，这才终于使得政府开始制定措施改善战地士兵的卫生条件，降低了士兵的死亡率。因此这幅图被称...阅读... 阅 读 全 部 >
本文首发于微信公众号 *“ 生信补给站 ” ，期待您的关注！！！*"一张统计图形就是从数据到几何对象(geometric object, 缩写为geom, 包括点、线、条形等)的图形属性(aesthetic attributes, 缩写为aes, 包括颜色、形状、大小等)的一个映射。此外, 图形中还可能包含数据的统计变换(statistical transformatio...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >