本文根据 2016 年 8 月复旦大学倪挺教授在「表观基因组学暑期国际讲习班」中的报告整理而成，本文采用第一人称叙述，文中的“我”皆指倪挺教授。报告原视频详见： 表观遗传系列视频13 | 复旦倪挺：表观遗传调控与基因剪接（附PPT） ，视频全长约 2h34min，文字约 1.6 万字。虽然是四年前的视频，但内容依然不过时，可帮助我们快速建立对转录水平表观调控的认识。 倪挺博士，复旦大学...阅读全... 阅 读 全 部 >
❝如大家所知，RNA是由DNA转录而来的。然而，作为一个转录本来源的DNA转录区域却不一定是由某个连续DNA片段提供的，其中甚至可能有间隔DNA转录区的交叉，不同区域不同顺序的转录产物共同组成一个转录本，极大增加了DNA产生RNA的复杂度。高通量测序和表达谱芯片可以检测这种非常有意义的转录本剪接，今天小编就带大家简单了解一下可变剪接。❞概述可变剪接是指从...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化能关闭某些基因的活性，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。甲基化的主要形式有5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基鸟嘌呤。原核生物中CCA/TGG和GATC常被甲基化，而真核生物中甲基化仅发生于胞嘧啶。DNA的甲基化是在DNA甲基化转移酶（DNMTs）的作用下使CpG二核苷酸5'端的胞嘧...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
我们平常通过数据库查找某个基因的相关信息时，会发现该基因有多个转录本。为什么一个基因可以有多个转录本呢？转录本能干什么？转录本其实就是基因通过转录形成的一种或多种可供编码蛋白质的成熟的mRNA。一个基因有可能有多个转录本，原因是由于不同的剪接方式造成的。我们都知道，基因转录之后，首先是形成前体mRNA，通过剪切内含子连接外显子，5’端加帽及3’端加尾之后形成成熟的mRNA。...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
猫咪的翔到底有多臭，相信很多铲屎官已经有深深地体会了但不知道有没有铲屎官都曾经历过：明明猫咪在旁边躺得好好的，或只是刚好从你身边路过而已，但空气中却突然传来一股臭味，而放在不远处的猫砂盘明明已经是清理过了。为啥有臭味呢？这时候铲屎官不用怀疑，那味道就是你家猫咪刚放出来新鲜的屁因为猫咪是肉食性动物，体内的微生物分子很多，产生的屁浓度较高，所以大部分猫咪在放屁的时候...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
种牛的品质与遗传性的优劣与【优良肉牛品种】，直接关系到后代的品质与 生产力。因此，在育种和生产实践中，不仅要选好种母牛， 更应重视选好种公牛。一般地说，公牛对后代的早期生长发 育速度，骨骼形成的能力，胸肌和腿肌的厚度，产奶量等遗 传影响都较大，而母牛对后代体重和繁殖力影响较大， 由于早熟性和产奶量均具有重要育种价值和经济价值。显然突出公牛作用很重要 一个普通的母牛，终生产肉牛犊只有8 -10...... 阅 读 全 部 >
责编 | 兮 我们的肠道中定殖着与身体细胞数量相当的微生物，包括细菌、真菌等。不同个体肠道微生物组成存在着差异，且在诸如荷兰Lifelines、芬兰FINRISK、英国UKbiobank、比利时FGFP、美国HMP等大型人群队列研究中发现个体肠道微生物组成的差异与健康和疾病相关，包括心血管病、糖尿病、炎症性肠病、癌症等。然而个体间肠道微生物菌群组成及遗传结构可随着时间而变化，了...阅读... 阅 读 全 部 >
上发表题为Microbiomes as sources of emergent host phenotypes综述，在这篇综述中，作者回顾了有关宿主因素对微生物群落结构的贡献，以及微生物组对新兴宿主表型的相应影响。此外，作者还特别关注了动物行为，并将其作为理解微生物组在影响宿主神经生物学潜在作用的基础。 一、宿主决定因素 动物以多种方式...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
本文约5300字，建议阅读10+分钟。本文将介绍数据清洗过程的主要步骤，并通过案例和代码演示如何利用R语言进行数据清洗。R是进行运算、清洗、汇总及生成概率统计等数据处理的一个绝佳选择。此外，由于它独立于平台、短期内不会消失，所以生成的程序可以在任何地方运行。并且，它具备非常棒的辅助资源。本文摘录自James D.Miller撰写的《数据科学统计学》（Statistics for Data S...... 阅 读 全 部 >
dplyr软件包是R中功能最强大，最受欢迎的软件包之一。该软件包由最受欢迎的R程序员Hadley Wickham编写，他编写了许多有用的R软件包，如ggplot2，tidyr等。本文包括一些示例和如何使用使用dplyr软件包来清理和转换数据。这是一个关于数据操作和数据处理的完整教程。什么是dplyr？dplyr是一个强大的R软件包，用于处理，清理和汇总非结构化数据。简而言之，它...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
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