2022
08-29
08-29
R语言学习：行去重、时间处理、棒棒糖图、快捷键、模型可解释性
这一周R语言学习，记录如下。01行去重操作在一个实际数据项目，获取数据后，发现数据的行（样本）有重复，需要把重复行删除掉。dplyr包distinct函数，可以做行去重。# dplyr包library(dplyr)data <- data.frame(Column1 = c( 'P1', 'P1', 'P2', 'P3', 'P1'...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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SLAM-seq测序
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翻译组学测序研究利器|Ribo-seq&Polysome-seq
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Nature｜王华等揭示H3K4me3在转录调控中的具体作用
这一周R语言学习，记录如下。01行去重操作在一个实际数据项目，获取数据后，发现数据的行（样本）有重复，需要把重复行删除掉。dplyr包distinct函数，可以做行去重。# dplyr包library(dplyr)data <- data.frame(Column1 = c( 'P1', 'P1', 'P2', 'P3', 'P1'...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
08-21
【tidyverse】R中的tidyverse入门
1 什么是整洁数据？2 tidyverse怎么使用？tidyverse是由RStudio首席科学家Hadley Wickham开发的R套装的集合。 这些包作为大数据分析管道的一部分可以很好地协同工作。要了解这些工具及其协同工作的更多信息，请阅读R for data science。 对于R的新手，请查看我之前的Storybench教程：RStudio笔记本中的R入门。以下教程将介绍...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
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Microbiome | 植物促生菌诱导的DNA甲基化修饰在植物-微生物互作中的长期影响
发表期刊：Microbiome (IF=14.652)发表时间：2022.2合作单位：南京农业大学样本类型：土壤DOI: 10.1186/s40168-022-01236-9研究背景在土壤微生物中，植物生长促进细菌 (PGPB) 是工程微生物组应用于农业的重要环节，包括改善生物控制和植物生长，PGPB 可以加强植物的养分吸收或调节植物激素水平，或通过抑制各种病原体和增强免...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
08-21
这些条形图的用法您都知道吗？
前言条形图专用于离散变量和数值变量之间的可视化展现，其通过柱子的高低，直观地比较离散变量各水平之间的差异，它被广泛地应用于工业界和学术界。在R语言的ggplot2包中，读者可以借助于geom_bar函数轻松地绘制条形图。对于条形图大家对其的印象是什么呢？又见过哪些种类的条形图呢？在本篇文章我将带着各位网友说道说道有关条形图的哪些品种。ggplot2的语法讲解如果读者对...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
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小白R语言数据可视化进阶练习一
作者：路遥马亡R语言中文社区专栏作者知乎ID：https://zhuanlan.zhihu.com/c_13540979700布局参数先介绍一个布局参数：#par(mfrow=c(a,b)) #表示在PLOTS区域显示a行b列张图 par(mfrow=c(3,1)) x <- rnorm(100) y <- rnorm(100) plot(x, y, xlim=c(-5,5),...阅... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
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R语言学习：添加文本标签、流转分析漏斗图，聚合函数，EDA，雷达图，TidyX项目
这一周R语言学习，记录如下。01添加文本标签信息可视化时，通过文本标签对图形做标注，让图形更有效表达信息。以ggplot2包的条形图为例，使用geom_text()函数给条形图添加文本标签。library(ggplot2)set.seed( 123)data<- data.frame(x = sample(LETTERS[ 1: 6], 300, re...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
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用R语言把数据玩出花样
R语言作为统计学一门语言，一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发，R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入，R语言的社区在迅速扩大成长。现在已不仅仅是统计领域，教育，银行，电商，互联网…都在使用R语言。要成为有理想的极客，我们不能停留在语法上，要掌握牢固的数学，概率，统计知识，同时还要有创新精神，把R语言发挥到各个领域。让我们一起动起来吧，开始R的极客...阅... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
08-21
画图必看：这些技巧让你的条形图变得高大上！
在前面的推文中，我给大家介绍了绘制条形图时常见的几种误区，以及如何避免误区，以提升条形图“逼格”的方法，权当抛砖引玉了。上期推文链接：今天将给大家继续介绍条形图，希望大家能够通过我的介绍，获得一些启发。条形图最常规的用途是展示变量的频数分布。条形图虽然看着呆板，但它也有几个“兄弟姐妹”，即我们可以使用其他形式的图形来展示条形图中相同的信息！这句话说起来很简单，但是在实际操作过程中，大家还是需要根据... 阅 读 全 部 >
2021年第39周。这一周R语言学习，记录如下。01Modern Statistics with R 一本在线开放书籍，介绍R语言做数据整理和探索，以及推断和预测的工作。访问网址：http://www.modernstatisticswithr.com/02R4DS书籍最近，我在重温R4DS这本书籍。你所想的数据科学是什么？实际...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
08-21
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ggplot2学习笔记系列之利用ggplot2绘制误差棒及显著性标记
taoyan：伪码农，R语言爱好者，爱开源。个人博客: https://ytlogos.github.io/公众号：生信大课堂绘制带有误差棒的条形图library(ggplot2)#创建数据集df <- data.frame(treatment = factor(c(1, 1, 1, 2, 2, 2, 3, 3, 3)),response = c(2, 5, 4, 6, 9, 7, 3, 5... 阅 读 全 部 >