SLAM-seq测序
翻译组学测序研究利器|Ribo-seq&Polysome-seq
Nature｜王华等揭示H3K4me3在转录调控中的具体作用
在我们的工作生活中，不管是程序员还是非程序员，都会遇到一个需求，那就是对一堆文件进行重命名。在 Windows 下有很多优秀的软件可以帮助我们完成这个需求，而在 Linux 环境下，我们可以简单敲一些代码就可以完成这个需求。本文将介绍三种最基本的文件重命名方法，因为比较基础，所以老司机可以到此为止。rename 命令顾名思义，rename 命令就是用来进行重命名文件名的。rename 命令有非常强... 阅 读 全 部 >
cp 和 mv 之外，在 Linux 上有更多的复制和重命名文件的命令。试试这些命令或许会惊艳到你，并能节省一些时间。Linux 用户数十年来一直在使用简单的 cp 和 mv 命令来复制和重命名文件。这些命令是我们大多数人首先学到的，每天可能有数百万人在使用它们。但是还有其他技术、方便的方法和另外的命令，这些提供了一些独特的选项。首先，我们来思考为什么你想要复制一个文件。你可能需要...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
识图：先理解 每个点是什么 （点代表基因、样品、通路或其它的，这个认识可以来自于常识，来自于自己对数据的认识，或来自于文章作者的描述），然后看 横轴代表什么 、 纵轴代表什么 ，再看图例中展示的其他信息如颜色、大小和形状分别代表什么。这些都理顺了，图理解就不难了。来源：https://www.r-graph-gallery.com/272-basic-scatterpl...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
原文链接：http://tecdat.cn/?p=8032可以直接从R / RStudio制作在线交互式图表和地图。配置启动RStudio，创建一个新的RScript，然后将工作目录设置为下载的数据文件夹。使ggplot2图表成为交互式Plotly图表制作交互式 点线图以下代码将安装并加载程序包（该程序还将自动加载ggplot2），加载readr和dplyr，然...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
R（又称R语言）是一款开源的跨平台的数值统计和数值图形化展现工具。通俗点说，R是用来做统计和画图的。R拥有自己的脚本语言和大量的统计、图形库（得益于开源社区），这让她看起来既美又实用。与其他同类软件（如 SPSS）相比，R的特点是纯命令行的，这倒也好，我们更应该把注意力放在数据本身，而非统计工具的UI。R虽说有一套自己的语言，还挺完备，但它最专业的还是做统计和画图，而像连接数据库、文本处...阅读... 阅 读 全 部 >
封面来源于：Pixabay+易生信生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括、 高颜值在线绘图和分析 、转录组分析 ）、ChIP-seq分析 （）、单细胞测序分析 ()、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（） 、 批次效应处理 等内容 。所以关注火山图（其它类型图也是），先理解 每个点是什么 （点代表基因、样品、通路或其它的，这个认识可以来自于常识，更准确的是看作者的描述），然后...阅读... 阅 读 全 部 >
这里我们就要讲讲如何从海量的芯片数据中寻找到差异表达的基因。首先，我们得知道为什么我们需要找这些差异表达的基因。其实在肿瘤的发生发展过程中，很多平时沉默的基因开始高表达，而原本那些正常表达的基因，它们的表达量可能就会下调。也恰恰这些与平时正常基因表达量发生变化的基因，它们的存在启动了肿瘤的发生。所以，如果我们要研究肿瘤发生的机制，研究这些差异表达的基因是必不可少的。利用在线工具...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
转录组作为研究分子机制最常用的科研手段，几乎每个科研工作者都会与它有那么一两段缘分，今天就带大家一起来通过图说的形式，了解下转录组结果中的重点分析内容，闲话不多说，上干货！图说一、 生物学重复平行性检验-相关性分析热图+PCA图转录组测序目前普遍要求进行检测的每个组别，是少需要三个生物学重复，以保证结果的科学性。生物学重复的平行性越好，重复作为一个组呈现时，分析的结果越可靠，因此，...阅读全文&... 阅 读 全 部 >