2024
12-31
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一文详解转录因子研究策略
一、转录因子与靶基因互作在一文详解转录因子研究策略（上）中，小源着重从转录因子的筛选及鉴定、转录因子功能验证这两个方面进行了详细阐述。本次，小源将继续带大家深入了解剩下的两部分内容（转录因子与靶基因互作、转录因子与其他转录因子或蛋白互作）。转录因子与靶基因启动子的顺式作用元件结合才能发挥作用，调控靶基因表达，靶基因与转录因子互作也是转录因子研究的一个重要方面。那么，转录因子自身基因...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
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lncRNA如何预测其靶基因？整个流程可以用两句话总结：将IP与input进行callPeak的结果与已知lncRNA进行相交，将交集得到的lncRNA进一步查找其附近具有功能的Protein-coding基因，随后对这些基因进行功能富集分析。 如下图所示，流程图展示了如何使用RNA数据进行lncRNA的查找与其靶基因功能注释，IGV则将这个过程找到的基因进行可视化。流...阅读全文>>...