2022
04-08
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代谢组学实用锦囊:MetaboAnalyst代谢组学分析工具实操
编者按:代谢组学数据下机啦~如何进行数据筛选?如何进行数据标准化处理?本篇小鹿“安利“一款实用软件:无需复杂的EXCEL操作;无需自己写代码;也无需自己写脚本;可解决代谢组学下机数据地复杂分析?不相信请各位“看官”继续往下看...MetaboAnalyst工具软件MetaboAnalyst是一个基于网络的综合性工具套件,旨在帮助用户...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
目前组学的数据越来越多。其中代谢组学也是其中一个热点。关于代谢组学的相关分析目前用的最多的还是MetaboAnalyst (https://www.metaboanalyst.ca/) 。之前这个数据库一直都是4.0版本。最近刚刚更新了5.0的版本。趁着刚刚更新,我们也就来顺带的介绍这个数据库吧。PS: 从18到现在被引次数就到了1700。可见这个数据库的权威以及研究代谢的人多呀关于MetaboA...
近几十年,系统生物学慢慢走近科研者的视野,主要着眼于研究细胞信号转导、基因调控网络和生物系统的组成。多组学联合分析可以由表及里,解析直接原因和根本原因,深入阐释作用机理。在多组学的联合应用中,最终都要落脚到功能注释和通路富集分析,其中基于通路富集分析的图形展示丰富多样,通过此分析可找到与研究相关的通路、关键基因/代谢物,以便进行后续的数据挖掘。小鹿在往期文章中,向大家推荐过一个代谢...阅读全文&...
代谢组学(Metabolomics)是生物体内生化反应的总成,是生命体维持生命的物质基础,也是研究生命活动的重要基础。代谢组学是基于高通量分析和生物信息学技术,研究生命在内、外环境影响下的内源代谢活动,包括对代谢产物种类、数量及其变化规律的检测和分析,从而研究集体生命活动发生和发展的本质。代谢物作为生物学过程的终端产物,其状态改变能够准确地反应细胞功能的变化。研究表明,包括癌症在内的多种疾病......
案例在手,思路不愁!今天继续为大家分享几篇微生物组+代谢组多组学应用在肠道样本中的文献案例。案例1:原名:Microbiome-metabolome reveals the contribution of gut-kidney axis on kidney disease译名:微生物-代谢组学揭示了肠道-肾轴对肾脏疾病的贡献期刊:Journal of Translational M...阅读全文&...