2023 05-02 公共数据库也能发NG—lncRNA研究新思路 lncRNA功能和机制的研究,成为了现如今科学界的“新宠”。超高的关注率,说明在这个领域能发表一篇高水准的科学论文,需要付出更多的努力和超前的思路。今天,就为大家带来Nature Genetics的一篇关于lncRNA的文章,让小编给大家一步步解释作者是如何通过整合公共数据库的结果,验证了作者的科学假设,发表了大N G。简单介绍:论文题目:Modulation of long no...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2023 05-02 利用102份玉米基因型重测序及转录组数据揭示热胁迫响应相关的基因组调控元件 基因表达的改变是植物适应环境变化的一种机制。热是一种非生物胁迫,可以在许多方面影响植物。平均温度的微小变化会导致平均产量的降低。繁殖期间严重的热胁迫事件会导致结实率的重大变化。营养早期的热胁迫事件会导致叶片衰老和生长速率降低。植物转录组分析发现,许多基因在非生物胁迫下表现出转录物丰度的变化。热休克因子(HSF)转录因子(tf)在热胁迫下被激活,并通过与顺式作用元件的相互作用调节许多基因的表达...... 阅 读 全 部 >
2023 05-02 单细胞联合还能这样玩,单细胞和EQTL联合分析确定疾病机制和潜在的治疗方法 毫无疑问多组学联合的实验设计对于解析生物学问题是十分有效且敏感的。相对于单组学来说,起到的是1+1>2的作用。多组学就像是一条河流,从最初的DNA(基因组)到转录水平(转录组)以及解析来进行翻译(蛋白组),以及下游对于代谢物质的研究(代谢组)。同时还有多种表观修饰发挥作用(表观组学),不同的外部微生物环境也会造成差异(微生物组)。从变异或者表达水平单方面去解析生物学问题,毫无疑问在当今...... 阅 读 全 部 >
2023 05-01 懒人福音,做ceRNA的都给我进来看! LncACTdb 2.0数据库食用指南Hello,小伙伴们大家周三好~本周我们继续来讨论一下lncRNA的一个大热功能,也就是lncRNA的ceRNA机制。ceRNA是个啥,相信各位小伙伴们已经非常清楚了,无论是酸谈老师的直播还是文献品谈会都介绍了大量的ceRNA的案例文献。在ceRNA的机制中,一共有三个变量参与,以lncRNA为例,最最常见的ceRNA结构就是lncRNA—miRNA以及miR... 阅 读 全 部 >
2023 05-01 综述 | 癌症全基因组关联分析的现状与未来 全基因组关联分析(GWAS, Genome-wide association studies)是研究复杂疾病的遗传基础的策略之一。在肿瘤研究领域中,几乎所有常见恶性肿瘤的GWAS均已完成,并确定了与风险增加相关的450多个遗传变异。这些研究不仅揭示了致癌的新途径,而且还表明了常见的遗传变异大幅增加了许多常见癌症的遗传风险。GWAS有望应用于药物研发和癌症预防,助力精准预测、诊断和治疗。当前G...... 阅 读 全 部 >
2023 04-30 项目文章丨单细胞测序揭示原发及转移性肝癌的免疫微环境特征 日前,Nature Communications 发表了来自军事医学科学院放射与辐射医学研究所研究员周钢桥课题组关于肝癌的最新研究。研究利用单细胞转录组测序绘制了原发性及转移性肝癌单细胞图谱,揭示了肝癌微环境的免疫细胞群体的构成并评估了慢性 HBV/HCV 感染与 T 细胞浸润和耗竭之间的关系。同时,研究还发现一群与肝癌进展及转移密切相关的 MMP9+ 肿瘤相关巨噬细胞(TAM),在...阅读全文... 阅 读 全 部 >
2023 04-30 文献解读基于单细胞RNA测序观察牙周炎骨免疫微环境 期刊:Theranostics技术:单细胞测序研究背景慢性牙周炎是由牙周组织的慢性炎症组成的常见疾病,它是一种在人类中非常普遍的疾病,影响全球约20%-50%的人口。慢性牙周炎可使个体易患全身性疾病,例如心血管疾病、糖尿病和阿尔茨海默病,以及胃肠道疾病和不良妊娠结局。牙周炎治疗的主要目标是控制消息和炎症,阻止牙周组织破新,防止牙槽骨丢失。在牙周炎进展过程中,大量...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023 04-28 Nature communication | 长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展 长读长测序揭示宫颈癌中HPV高分辨率整合及其致癌进展HPV(人类乳突病毒)整合入人类基因组,往往被认为是宫颈癌发展的重要环节之一,但具体的整合位置和机制目前尚未完全被揭示清楚。在本文中,来自浙大医学院附属邵逸夫医院和附属妇产科医院、华中科技大学和温州中心医院等单位的研究者采用Nanopore测序技术,对16 例HPV16阳性的宫颈肿瘤样品进行大规模检测,重点关注 病毒-人基因组整合事件;相关成果发... 阅 读 全 部 >
2023 04-25 这是一篇“一看就懂”的单细胞测序文章! 今天跟大家分享一篇单细胞数据分析加简单验证实验的生信高分文章。对!没有其它分子类型或多组学数据联合分析,如果仅用scRNA数据发表10+文章?下面我们来一探究竟!文章题目:Single-cell analysis of human testis aging and correlation with elevated body mass index.研究背景衰老的男性表现出生...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >
2023 04-24 进化论VS中性突变理论 进化论VS中性突变理论查尔斯·罗伯特·达尔文(英语:CharlesRobert Darwin,1809年2月12日-1882年4月19日),英国生物学家,其“进化论”被列为19世纪自然科学的三大发现之一(其他两个是细胞学说、能量守恒转化定律),对人类有杰出的贡献。达尔文早期因为地质学研究而著名,而后又提出科学证据,证明所有生物物种是由少数共同祖先,经过长时间的自然选择过程后演化而成。到了193..... 阅 读 全 部 >