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2022
05-26

基因家族分析流程及保姆级实操流程

森言森语下午开完组会，吃过晚饭终于得空干点别的，于是决定将之前写过的这篇关于基因家族分析的推文再检查完善一下。检查日志2021年9月30日：黄底红字为更新内容，其他色彩为原文。最近的一段时间是倦怠的，虽然忙，却实际上浑浑噩噩，没有长进。不管怎么样，一个阶段的结束，总要写点东西来宣告它的结束，然后迎接新的开始。已经很久没有跑步了，原本计划今年参加6月份的兰州马拉松...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
05-25

R语言实战—简单数据分析

作者：Carson 数据分析师，R语言中文社区专栏作者。知乎专栏：https://zhuanlan.zhihu.com/carson-0814数据源：朝阳医院2016年销售数据分析指标：1、月均消费次数；2、月均消费金额；3、客单价；4、消费趋势打开excel数据源，数据的基本字段如下：一、将excel数据源导入R中二、对数据进行预处理“数据是一件麻烦的事——一件非常非常麻烦的事。”，数据分析工作... 阅 读 全 部 >
2022
05-24

手把手教你用R处理常见的数据清洗问题（附步骤解析、R语言代码）

作者：James D. Miller;翻译：王雨桐;校对：万文菁本文约5300字，建议阅读10+分钟。本文将介绍数据清洗过程的主要步骤，并通过案例和代码演示如何利用R语言进行数据清洗。R是进行运算、清洗、汇总及生成概率统计等数据处理的一个绝佳选择。此外，由于它独立于平台、短期内不会消失，所以生成的程序可以在任何地方运行。并且，它具备非常棒的辅助资源。本文摘录自James D.Miller撰写...... 阅 读 全 部 >
2022
05-23

30天学会R DAY5： R语言对象的操作总结

第五天 R语言对象的操作总结R语言主要分析的对象是数据集，R语言数据集主要是向量、矩阵、数据框、列表、数组等，我们主要介绍前4种。前面2文已经进行了4种对象的介绍，现在本文将4种对象的程序方法进行进一步总结和凝练。一、is和as系列函数is 和as系列函数涉及不同类型数据和对象的鉴定和转换。我们经常在R语言编程过程中需要了解某一种数据的类型，也可能进行转换方便计算，所以诸位要熟悉他...阅读全文&... 阅 读 全 部 >
2022
05-22

48个实用的生信在线工具

在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。之前，在基迪奥生物的微信公众号分享过32个常用的生信在线工具，广受欢迎，这里再补充16个。基因结构绘制1.Exon-Intron Graphic Maker工具链接：http://www.wormweb.org/exonintronRNA二级结构2.Mfold工具链接：h...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2022
05-22

Ensembl biomart工具简介

Ensembl（ensembl.org）网站是常用的物种参考基因组来源之一，网站提供的biomart工具可以对物种的基因进行功能注释，以及跨数据库注释。以下介绍使用的操作步骤：1.打开http://asia.ensembl.org/biomart/martview网址然后使用下拉框-CHOOSE DATABASE- 选择数据库，对应基因进行注释我们选则Ensem...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2022
05-21

ID转换不用慌，biomart帮你忙

大家好，我是Leopard。大家在处理生物信息数据，比如RNA-seq数据、芯片数据，或者从TCGA数据库下载的数据时，都会遇到各种各样的ID！这些ID就像是我们每个人的身份证，用于对基因进行标识。由于ID来自于不同的数据库，或者说命名的意图不同，所以对于同一个基因，总是有多个不同的ID，最常见的比如entrze ID、ensembl ID、HGNC ID、refseq ID等。Entrze ID... 阅 读 全 部 >
2022
05-20

Linux计划任务那点事儿

Linux 中经常看到利用 crontab 留后门，从接触的样本看多利用方式多是:① 是直接利用 crontab 命令；② 直接修改/etc/crontab。不论是样本，还是博客对其它方式讨论较少。本文主要讨论：① 计划任务有哪些类别；② 直接修改数据文件方式创建计划任务及其中的关键点；li...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
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