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2021
11-04

来说说关于DNA甲基化检测和CpG岛的小常识

DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,可能存在于所有高等生物中。DNA甲基化能关闭某些基因的活性，去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。甲基化的主要形式有5-甲基胞嘧啶,N6-甲基腺嘌呤和7-甲基鸟嘌呤。原核生物中CCA/TGG和GATC常被甲基化，而真核生物中甲基化仅发生于胞嘧啶。DNA的甲基化是在DNA甲基化转移酶（DNMTs）的作用下使CpG二核苷酸5'端的胞嘧...阅读全文>... 阅 读 全 部 >

2021
11-02

基因研究不知道转录本，做什么引物设计？！

我们平常通过数据库查找某个基因的相关信息时，会发现该基因有多个转录本。为什么一个基因可以有多个转录本呢？转录本能干什么？转录本其实就是基因通过转录形成的一种或多种可供编码蛋白质的成熟的mRNA。一个基因有可能有多个转录本，原因是由于不同的剪接方式造成的。我们都知道，基因转录之后，首先是形成前体mRNA，通过剪切内含子连接外显子，5’端加帽及3’端加尾之后形成成熟的mRNA。...阅读全文>&... 阅 读 全 部 >

2021
07-23

DNA琼脂糖凝胶电泳

（一）操作规程1.制胶（1）根据所需浓度称取一定量的琼脂糖加入干净的三角瓶中，加入100mL 0.5×TBE电泳缓冲液，放入微波炉中溶解。注意不要沸腾。（2）将制胶模板两端用胶带封好，调节水平，插入梳子。待凝胶在室温冷却到60℃左右加入EB（终浓度0.5µg/mL）混匀，倒入模板中。注意倒胶要连续，千万不能有气泡。（3）凝胶自然冷却后，取出梳子，去掉胶...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2020
01-29

扩增子图表解读2散点图：组间整体差异分析(Beta多样性)

背景介绍(Introduction)宏基因组学宏基因组学目前的主要研究方法包括：16S/ITS/18S扩增子、宏基因组、宏转录组和代谢组，其中以扩增子研究最为广泛。目的意义本系列文章将带领大家结合较新的16S扩增子相关文献，来理解宏基因组16S扩增子文章中常用图表种类、图中包括的基本信息，以及作者想表达的结果。主要内容本系列文章内容包括：箱线图、散点图、热图、曼哈顿图、维恩图、三元图和...阅读全... 阅 读 全 部 >

2019
06-28

DNA提取过程中各种试剂的作用

EDTA螯合Mg2＋、Ca2＋等金属离子；抑制脱氧核糖核酸酶（DNase）对DNA的降解作用（DNase作用时需要一定的金属离子作辅基）；EDTA的存在，有利于溶菌酶的作用，因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。SDSSDS是离子型表面活性剂;溶解细胞膜上的脂质与蛋白，因而溶解膜蛋白,从而破坏细胞膜；解聚细胞中的核蛋白；SDS能与蛋白质结合成为R-O-SO3-...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >

2019
01-20

16S 基础知识、分析工具和分析流程详解

16S概念什么是16S？S是什么意思？16S分析是用来干嘛的？能分析什么？16S大致的分析原理是什么？有点生物学基础的会知道16S和核糖体有关，但大多数还是搞不清楚它们之间的关系。先明确一些概念：核糖体：Ribosome，由 RNA(rRNA）和蛋白质 组成，配合 tRNA 来翻译 mRNA。核糖体按沉降系数来分类，S就是沉降...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >