2023 12-15 靶标确证 这阶段是确证选定靶标的调控会引发预期的生物效应并与临床治疗相关。常用的方法有基因突变、基因敲除、使用抗体、药物抗性突变和siRNA等。值得关注的是,51%的临床二期的失败都是由于药效不够,很多都归因于前期靶标确证工作的不足。这一阶段的失败随之而来的是后期巨额投入的付之东流。疾病关联临床靶标确证平台(https://www.targetvalidation.org/)整合了...阅读全文>&g... 阅 读 全 部 >
2023 12-15 金线莲干预2型糖尿病的“关键成分-潜在靶标-核心通路”网络挖掘及实验验证 糖尿病是一种以血糖升高和代谢紊乱为主要特征的疾病,属中医学“消渴病”范畴。其中2型糖尿病占所有糖尿病患者的95%左右,严重威胁人类健康[1]。2型糖尿病又称为非胰岛素依赖型糖尿病,多发于肥胖及中老年人群,患者体内胰岛素分泌相对不足或作用效果不佳。2型糖尿病可诱发多种并发症,包括糖尿病心血管疾病、糖尿病肝病、糖尿病肾病等。临床上治疗2型糖尿病一般分为注射胰岛素和口服降糖药2种方案。然而,这2种方案的... 阅 读 全 部 >
2023 12-11 药物发现过程中人工智能的应用研究进展 在过去的20年中,生物学家和化学家一直致力于开发一种高效和先进的药物发现和评价系统[1],不仅可以高效率地发现靶向治疗药物,而且可以降低潜在药物不良反应的发生风险。为了减少新药开发的时间并降低费用,科研人员将目光转向了基于计算机和大数据的方法,如虚拟筛选(VS)和分子对接,但这些方法具有准确性差和效率低等问题[2]。人工智能(AI),包括深度学习(DL)和机器学习(ML)算法,有望可以克服在药物设... 阅 读 全 部 >
2023 12-03 科普 | DisGeNET,与疾病相关的基因公开数据库有什么好的? DisGeNET数据库是一个与疾病相关的基因数据库,整合了来自各种存储库(包括孟德尔,复杂和环境疾病)的人类基因疾病协会(GDA)和变异疾病协会(VDA)的信息。具体技术包括对基因-疾病词汇的mapping、DisGeNET本体分析。网址:https://www.disgenet.org/目前的版本DisGeNET v4.0,包含17,381个基因,15,093 种疾病、异常和...阅读全文>... 阅 读 全 部 >
2023 11-05 直接下载网易云音乐中歌曲MP3格式的方法 第一步:获取歌曲ID打开网易云音乐,随意选择一首歌曲,在浏览器网址中或客户端分享歌曲链接中复制歌曲的ID。 例如,《我曾》这首歌的ID为1336856777。第二步:获取歌曲直链获取歌曲ID后,直接拼接获取歌曲的直链。 例如,《我曾》这首歌的直链为:[http://music.163.com/song/media/outer/url?id=13368...阅读全文>>... 阅 读 全 部 >
2023 11-04 用Excel就能分析生物数据,真后悔没早点安装插件GenAlEx GenAlex是一款应用于EXCEL的生物数据分析工具插件,运行后可以在Windows的excel中使用,功能强大又好上手。它可以对共显性数据、单倍体数据和二元数据进行分析。GENALEX还提供了一系列基于频率的分析, 20多种不同的图表总结数据辅助检测。除此之外,序列信息和基因型数据可以方便地在相关软件中转化格式。操作步骤建立一个表格,第一行首先写上位点数,个体数,居群数,然后开始与第二行对应标... 阅 读 全 部 >
2023 10-15 基于SSR分子标记的裸花紫珠种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 裸花紫珠Callicarpanudiflora Hook. et Arn为马鞭草科紫珠属植物,干燥叶入药,主产于海南、广东、广西等省份,是海南省道地药材和黎药大品种,为《中国药典》2020年版唯一新增收载药材,具有消炎、解肿毒、化湿浊、止血等功效[1]。课题组前期对海南岛裸花紫珠种质资源进行调查,发现生产上尚无优势品种,人工栽培种苗大部分来源于自留种,长期以来会导致种质混杂,药材产量与质量参差不齐... 阅 读 全 部 >
2023 10-08 快速入门群体结构分析,Structure教程来了! Structure是由斯坦福大学Pritchard实验室开发的一款群体结构分析软件。structure可通过贝叶斯聚类方法对每个样本的来源进行判断,进而反应群体的遗传结构。真正跑时burnin设为100000,跑100000代,k设为1-20,每轮运行10次。序列文件用xmfa2struct转为structure可识别的格式,SSR用Genalex转为structure可识别的格式。操作步骤打开s... 阅 读 全 部 >
2023 10-07 GENEPOP:一个非常实用的群体遗传学分析软件 GENEPOP是一个非常实用的群体遗传学分析软件 ,适用于对大量的群体遗传学数据进行分析。下面我们就来介绍一下它的使用方法。操作步骤先用GenAlEx把数据转为Genepop格式格式转好了放到程序目录下,删除其他之前运行剩下的结果文件,仅保留三个文件运行软件,输入输入文件的名称确认信息,回车可以进行很多项分析一共有8个选项:1.Hardy-Weinberg test:进行种群内各位点的平衡状态及种... 阅 读 全 部 >
2023 10-07 arXiv的优缺点如此明显,未来是否应该引入评论与同行评议? 选自Authorea参与:路雪、刘晓坤、李亚洲arXiv 是当前最流行的预印本库。自 1991 年创办以来,arXiv 为研究者提供了一个在正式同行评议之前分享预印本文章的平台。新技术使文档创建和分发更加便捷,文化实践推动合作和数据共享,这使得 arXiv 快速发展,日渐流行。arXiv 在研究交流和 Web 历史上占据独特的位置,但是它自创建以来几乎很少改变。在此文章中,我们看一下 ...阅读全... 阅 读 全 部 >