Cytoscape是一个优秀的生物软件平台，可以完成很多的生物学分析，我们可以使用cytoscape中的bingo插件，完成模式物种的GO富集分析。

首先，打开cytoscape，安装bingo插件

运行bingo

输入保存名称

输入差异基因

输入检验方式与阈值

输入要聚类的条目

选择物种

保存

运行，得到富集结果

可以看到，颜色越深，代表越显著，圆圈越大，代表富集到的基因越多

颜色表示的数值

可以将网络图导出

导出为pdf

得到表格形式的结果文件

用excel打开查看，信息包括GO号，p-value,富集的基因个数，描述，以及基因的列表，这是通过费歇尔检验得到的富集结果。