眼前一亮的基因组共线性图，用mauve就行
2023-1-12 萌小白
比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是最漂亮的，共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。Mauve是一款非常简便高效的基因组比对工具，可以用它来画基因组共线性图。下面我们就来介绍一下使用方法。
操作步骤
安装Geneious
安装Mauve插件 
将基因组导入 
选中要比对的序列 
选择比对全基因组 
默认参数，OK 
等待程序运行完
结果出来了，紫色部位是重排区 
放大之后的效果，可以看到基因组位点间的线性关系 
再放大可看到碱基间的线性关系 
可以将图片导出
导出后的效果，可用AI等修改 
好了，以上就是使用mauve画基因组共线性图的操作 。如果文章对你有所帮助，请转发给你身边需要的人噢！
发表评论：