小众但对科研帮助非常大的数据库--引物、结构域、功能
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小众但对科研帮助非常大的数据库--引物、结构域、功能
2022-9-30 萌小白





一:GETPrime数据库



我们经常为寻找基因和特定转录本的qPCR引物所犯难,不用怕,在GETPrimer你可以得到所有基因的引物,并且考虑了SNP等情况。






直接可视化设计出来基因的位置。



二 InterPro






分析蛋白的相关结构域信息






三 ReFOLD



蛋白质3D模型的细化可以被认为是蛋白质结构预测的“终末游戏”。通常需要对预测模型进行微妙的改进,将它们移动到“最后一公里”之外,超出它们所基于的模板或片段,从而更准确地反映观察结果。同源蛋白质建模现在被普遍用于生命科学领域。然而,3D模型的许多生物学应用在很大程度上取决于模型的准确性,特别是在关键区域,如用于药物发现的结合位点。提高比较模型的准确性,超出了模板的信息,因此仍然是结构生物信息学中的迫切问题之一。



ReFOLD则提供了新的模式,为我们构建蛋白质结构等提供了新的信息。






小鼠基因表达数据库:






http://www.informatics.jax.org/expression.shtml



哺乳动物不同细胞系表达水平:






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